Wattenwyl wuchs in einer musikalischen Familie auf. Ab seinem achten Lebensjahr erhielt er zehn Jahre lang klassischen Klavierunterricht am Konservatorium Bern. Neben seinem Studium der Geschichtswissenschaften an der Universität Bern spielte er in Jazz-, Funk- und Latinbands, erhielt rudimentär Unterricht bei Silvano Bazan und Joe Haider, um 1998 am der Swiss Jazz School mit dem Diplom zu absolvieren. 1990 gründete er sein Trio, das er teilweise mit Bläsern erweiterte. Wattenwyl veröffentlichte bis 2015 zwölf Alben unter eigenem Namen; mit Eric Alexander leitet er das Generations Quartet (mit Reggie Johnson und Kevin Chesham). Als Pianist und Organist ist er auch ist auch auf Alben mit dem Martin Streule Jazz Orchestra, mit Rolf Häsler, mit Sandro Schneebeli und mit Larry Alexander zu hören. Wattenwyl arbeitete ferner mit Musikern der Schweizer Jazzszene wie Umberto Arlati, Peter Schmidlin, Walter Schmocker, Pius Baschnagel, Daniel Schenker, Mats Spillman, Christian Münchinger oder Daniel Aebi, aber auch mit Art Farmer, Clark Terry, Alvin Queen, Bobby Shew, Bob Mintzer, Johnny Griffin, Ryan Kisor, Eric Alexander, Sandy Patton, Rhonda Dorsey, Sharon Harris und Bert Joris.

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